Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms