Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms