Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms