Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms