Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf44Q3UHJ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms