Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Puf60Q3UEB3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms