Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trafd1Q3UDK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms