Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U6N9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U6N9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms