Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

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Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mmp25Q3U435 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp25Q3U435 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms