Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Palb2Q3U0P1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms