Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms