Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms