Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl4Q3TZA2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms