Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TchpQ3TVW5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms