Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd4Q3TT99 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd4Q3TT99 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms