Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms