Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smarca4Q3TKT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms