Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb38Q3LR78 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms