Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1aQ2LKU9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms