Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam171bQ14CH0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms