Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VgfQ0VGU4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VgfQ0VGU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms