Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms