Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmntd2Q0VET5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms