Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc21bQ0HA38 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms