Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf541Q0GGX2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf541Q0GGX2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms