Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms