Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SctQ08535 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SctQ08535 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SctQ08535 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms