Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb2Q08331 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms