Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms