Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nfe2Q07279 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nfe2Q07279 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms