Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah1bQ06985 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1bQ06985 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms