Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms