Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcad1Q04692 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms