Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smpd1Q04519 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms