Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnb1Q03717 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms