Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms