Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms