Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms