Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms