Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlh1Q02576 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms