Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnb1Q02248 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnb1Q02248 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms