Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms