Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd1Q01822 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms