Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme2Q01768 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms