Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2aQ01320 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms