Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2bQ01097 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms