Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp1Q00915 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms