Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms