Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Il6stQ00560 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Il6stQ00560 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms