Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brca2P97929 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brca2P97929 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms